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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一直以来做为化工工业原材料而被遵守的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“消化吸收废物回收”变成“宝库小分子结构”的心酸艰辛是类似的,到近三十年才被发现其最重要的生物工程学性能,从此之后“平躺农奴把演唱”,十分是在免疫性真菌感染性的病理论研究行业内独树一帜。多个篇本文宣传报道了在各式真菌感染性的病的猎物模形中争取衣康酸或其化工掩盖发展物工程的改善益处,消息队列现其未知靶点。就衣康酸的“前生”与“此生”,具体情况见推书《乳酸的逆袭之亲兄弟——衣康酸!篇文章一起去流浪学习衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应体现蛋清组学产品,实现1000+什么难以理解的度绘制位点检测,可靠重演径典靶点,全多方面生信介绍解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发觉”到“验正”全程序服务管理,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、调查工艺流程

02、测评数据信息

03、经“点”显现

在测试数据库中,检测出众多学术论文中通讯报道的精典靶点举例衣康酸绘制位点,如一是个被会发现的衣康酸共价绘制球蛋白质酶KEAP1,另外还有糖酵解通道中的3个要素酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,及其炎性小体组成的球蛋白质酶NLRP3和生殖细胞死亡流程中的要素球蛋白质酶RIPK3等,其质谱图相应图表达。

04、货品优势特点

1.多个质控

工业化特男人探头孵育、SDS-PAGE检侧、WB核实、样品相应的性探讨等相互位检侧,加强组织领导工作报告单安全性。

2.高效能质谱分析仪器电商平台

在Orbitrap Astral全新几代高判断质谱仪提升下,实行衣康酸性反应掩盖位点及球蛋白认定新强度,助推科学教育方案研究方案新发觉。

3.全的流程一趟式精准服务

根据拜谱海洋生物改善的实践游戏平台,可提拱“血细胞塑造→的判断器孵育→WB的判断→艰深度衣康硝化作用装饰的判断→专有生信探讨→指定位点PRM印证”全操作流程提供服务,省时先问更先问。

05、研究玩法(一些)

06、拜谱生物放向

PART 2、期刊论文每日分享

参考文献一

英文翻译标题文字:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

简体中文文章标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

钻研主要内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

论文参考文献二

英文翻译题目:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

常常文章标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

研究方案游戏内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、情况繁衍设想

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13包括不强的底物融入能力素质,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物技术衣康过酸掩盖组测量数据报告中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用修饰语(如下所示图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人心得体会

当做TCA循环法中的在期间分解物,衣康酸自动调节分解、免疫性细胞系统和发炎病变完美的完美效用,为诊治免疫性细胞系统发炎病变性症状能提供了了带替诊治方案。衣康酸组成中的亲电性α,β-不饱满羧酸组成能对血清质上的特异性半胱氨酸残基进行烷基化掩盖(迈克尔减伤表现),该英译后掩盖被称做“衣康酸掩盖(itaconation)”,而使作用血清质技能,控制免疫性细胞系统对答和分解行业,为三种症状药品科研开发能提供了新策略。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸呈现血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医美任何时候按量靶向药物分解组(QMT1000)或体力排泄率靶向治疗排泄率组商品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

选取论文毕业论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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