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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核怪物体mRNA中最终要的转录后修饰语,在真核怪物体的肠道疾病和人体生理进程中起着至关必要的的功效。血糖高社会认知心里障碍就是种不不可逆转的运动神经末梢神经末梢设备退行性肠道疾病,近些年经济发展.切原则已经完整体现了,而且没有可以有效的和预防和治愈具体方法。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱生物技术为其提供m6A甲基化探讨系统工作,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

好的文章公司名称:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

大家公司:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

钻研涂料:小鼠脑组织

拜谱出示技术性:m6A甲基化(MeRIP-seq)

论文摘要图:

图1| 前言图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

研究分析导致

1.DCI小鼠海马中m6A遗传基因淡化的变换

深入阐述人数一开始建造了高脂膳食和群体行为障碍物(DCI)的小鼠模形。为比对比组(n = 3)和DCI组(n = 3)之中的m6ADNA修饰语,深入阐述人数用MeRIP-seq去了转录组规模内的m6A-seq阐述。在DCI组的10664个代码DNA转录物(mRNAs)党中央挖掘对比组的23719个不重合的m6A峰。相对比后,DCI组情况出23,759个非重合m6A峰。这之中,9348个甲基化DNA在对比组和DCI组之中重合(图2)。

图2| 参考组和DCl组m6a遮盖基因遗传的维恩图

共认定出12715个地域差异甲基化的m6A位点(DMMSs),另外60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化技术水平分辨明显远远超出对比组。进行分析其规划现状挖掘m6A峰规划在一整块RNA中(图3A),并按照其规划的转录空间可分成如下五组:5'UTR、3'UTR、转录开始和结束位点空间段落、撤销PIN码子段落、开始和结束PIN码子段落和编号规则编码序列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和撤销PIN码子旁边明显含有(图3B)。为风险监测哪些人类表观遗传上m6A体现语的空间,分析拜谱生物需求了有峰注脚的空间,并测得了哪些人类表观遗传上reads的所覆盖面积。在DCI组中,m6A体现语区倾斜于3'UTR区(图3C)。所以mRNA内的DMMS都被精确定位到固色体上来风险监测其规划情况。的其他小鼠固色体的m6A体现语谱的其他。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的修改

考虑到检则m6A修饰语在DCI小鼠中的海洋分子生态学学职能,的研究者从两列下选择具有DMMS的血清质数字什么是表观遗传遗传对其进行GO和KEGG探讨(图4A)。在GO探讨中,高甲基化什么是表观遗传遗传在受损生殖神经元期间、海洋生态学期间调节、促使剂的作用活性氧酶类和杂环有机酸物融入中重要含有。KEGG通道探讨出现,高甲基化什么是表观遗传遗传与T受损生殖神经元多巴胺感觉讯号通道、小受损生殖神经元1.肺癌和RIG-I样多巴胺感觉讯号通道关于(图4B)。这对低甲基化什么是表观遗传遗传,GO探讨出现在受损生殖神经元期间、分解期间和融入期间中重要含有有机酸环有机酸物、融入杂环有机酸物和促使剂的作用活性氧酶类(图4C)。KEGG通道探讨体现了了低甲基化什么是表观遗传遗传与肥厚性心肌病和Hippo讯号通道的微信关联(图4D)。

图4| 之间的关系甲基化m6A位点的信号通路丰度

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据库的携手分享

陆陆续续调查员将m6A MeRIP-Seq的统计资料信息和此前RNA-Seq的统计资料信息使用联合技术进行分析,得知163个mRNA,m6A峰和mRNA能力为显著变换。41种mRNA的m6A和mRNA能力调整,14种mRNA能力调整。不但,30个人类染色体mRNA呈现方式调整,m6A能力调整,7七个人类染色体mRNA呈现方式调整,m6A能力调整(图5A)。接下来,构造 一个多个PPI网路来出现163个人类染色体代码的血清范围内的进行连接(图5B)。

就像文中6一样,GO和KEGG阐述可分为四组:(1) m6A上涨,mRNA上涨;(2) m6A上涨,mRNA上涨;(3) m6A上涨,mRNA上涨;(4) DNAm6A上涨和mRNA上涨。在GO阐述中,m6A上涨和mRNA上涨的DNA在上皮组织组织细胞系组织组织细胞系消化吸收环节、馨香族有机化合物菌物获得环节和RNA组织组织细胞系消化吸收环节的调节中相关性聚集。KEGG阐述提示 ,等DNA在皮脂酸组织组织细胞系消化吸收、小上皮组织组织细胞系非小组织组织细胞肺癌、丙酸组织组织细胞系消化吸收和异丙醇酸组织组织细胞系消化吸收中聚集。在m6A上涨和mRNA上涨的DNA,GO阐述提示 在亚铁融入起来、亚胺丙氨酸脱羧酶抗逆性、天冬氨酸1-脱羧酶抗逆性和上皮组织组织细胞系相连组装流水线负调节中聚集;KEGG阐述提示 在2型高血压、皮脂上皮组织组织细胞系因素的移动的信号移动的信号的信号环路和胰岛素的移动的信号移动的信号的信号环路中聚集。在GO阐述中,m6A上涨和mRNA上涨的DNA在寡肽融入起来、谷胱甘肽融入起来和二硫腐蚀物腐蚀还原系统酶抗逆性中聚集,而在KEGG阐述中,我们在柠檬汁酸循坏(TCA循坏)、丙酸组织组织细胞系消化吸收和多植物物种凋亡中聚集。在GO阐述中,m6A上涨和mRNA上涨的DNA在胚胎骨关节软骨特征进行、核蛋白激酶抗逆性更改密码和NADP组织组织细胞系消化吸收环节中聚集,在KEGG阐述中,m6A上涨和mRNA上涨DNA在新霉素、卡那霉素和周围神经鲜香美味因素的移动的信号移动的信号的信号环路中聚集。

图5| m6A甲基化与mRNA表达方法的联手浅析

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG了解

拜谱生物体工作小结

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱动物提供了m6A甲基化技艺工作,拜谱怪物可提供完善成熟的血清组学、分解组学、转录组学与多个学合作的产品的技术保障,欢迎致电咨询!

可以参考资料:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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