草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿平台最应见的消化道疾病之六。肾企业中CaOx多晶体过趋于稳定转变成会使得肾小管组织细胞问题和凋亡，核心在于使得肾结石的转变成。短链油脂多酸由肠子内水解酸化池日常细菌发醇饮食营养食物纤维制造，实际上在产品局部肠子深层中充分调动帮助，并且在平台水平面上也充分调动核心帮助。里面，丁酸是最多样化的短链油脂多酸，具有着消除炎症和免疫力调节帮助,本科研浅议丁酸对CaOx肾结石的帮助十分潜在性的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山大医院泌尿整形科吴忠硕士生导师、周子健院士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠讲解、周子健博士后在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物体与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网站临床药理学服务项目，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

短文简称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 企业客户单位名称：华山机构 科学研究另一半：大鼠、HK-2癌细胞 好友分组数据信息：对应组（Con）、建模组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱供应的技术：手机网络药理学学查测

思维注意事项图

研发没想到

探析技术人员先要创设大鼠整治，确认生理方面什么是生化目标和安排方面的问题学印染等探析途径察觉到丁酸行以减少CaOx整治大鼠肾CaOx晶胞的转变成和问题，改变CaOx整治大鼠的感染问题和被阳极氧化化合物的神经太过紧绷展现。不但，丁酸还可治理和改善草酸帮助的HK-2人体内部问题、被阳极氧化应激性和人体内部凋亡。 为来探寻丁酸框架和靶人类DNA网洛，钻研人员管理从PubChem添加丁酸和丁酸酯的二维和三维图框架（图1A）。能够 PharmMapper数据文件源报告库和Uniprot数据文件源报告库操作后共需求出1115个丁酸靶人类DNA供进三步探讨。将人类DNA所有拷贝到STRING数据文件源报告库，完成PPI网洛探讨。Cytoscape提出了编排的前20的联络线靶人类DNA的基本网洛图，包扩CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。等等联络线人类DNA与网洛中的其他的人类DNA均突出表现出千万的想关性，证明等等人类DNA很有应该充分利用着携手的功效。GO和KEGG探讨呈现了丁酸联络线人类DNA的想关行业和生态学工程学用途（图1C）。联络线人类DNA具体与类固醇荷尔蒙回应、氧化物物应激状态的功效回应、生态学氧氧生殖细胞对类固醇荷尔蒙畅快的的功效及其对含酸性化工产品的的功效关于 。由此可见所诉，等等联络线人类DNA具体通过了氧化物物应激状态的功效和对生态学氧氧的生态学工程的功效的时候，是肾结石变成考核机制中至关极为为重要的行业，这阐明丁酸很有应该在肾结石中充分利用极为为重要的功效。

图1| 丁酸结构类型与靶基因遗传互联网具体分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进那步探讨丁酸对CaOx肾结石真的切靶DNA遗传，研发有关于人群使用GEO的sql对GSE73680中健康的参考与CaOx肾结石人的DNA遗传对比完成了研发。参考组与CaOx结石人的同质性性对比把你想传达出来DNA遗传（DEGs）什么是什么是染色体检测规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个DNA遗传形成同质性不同，至少3379个（89.4%）DNA遗传把你想传达出来上浮，404个（10.6%）DNA遗传把你想传达出来降低（图2A）。对DEGs完成聚类分析探讨法探讨，热图凸显了前10个被选中DEGs的二维上下分层聚类分析探讨法表现（图2B）。随即，研发有关于人群利用GeneCards的sql手工鉴定费了370个或者与CaOx肾结石有关于的DNA遗传，排名榜前20位的預测DNA遗传以至于有关于性计分表达2C表达。是为了找寻丁酸治愈CaOx肾结石的重中之重靶点，研发有关于人群将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关于DNA遗传确定处理受到半个个Venn图。以后，CYP2C9被选择为丁酸危害CaOx肾结石的内在靶点(图2D)。不仅，研发有关于人群还完成了丁酸与CYP2C9的分子结构衔接，CYP2C9的三大氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸互不意义，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在巧用网药学学予测CYP2C9是丁酸影晌CaOx肾结石的靶DNA后，科研员还在上皮人体细胞进行实验核实了CYP2C9可大幅度降低草酸介导的HK-2上皮人体细胞的ROS关卡、细菌感染直接损伤和凋亡。

图2| 普遍据库综合探讨推测CYP2C9是丁酸帮助于CaOx肾结石的靶基因组

实验效果

本理论研究关键在于看到丁酸在休外和内均能控制CaOx肾结石模式的脱色应激状态性和细菌感染损坏，之后完成网格药学学筛分能够丁酸危害CaOx肾结石的隐藏靶点——CYP2C9，第四完成生殖神经元实践断定CYP2C9在草酸盐引导的HK-2生殖神经元ROS质量、细菌感染损坏和凋亡。以上看到表示丁酸也许完成控制CYP2C9来控制CaOx肾结石的脱色应激状态性，消减细菌感染损坏。某一的过程中拜谱微生物体具备了网格药学学工艺贴心服务保障，虽然拜谱微生物体可提升 旺盛期健全的什么是基因组学、血清质组学、代谢转化组学等两组学產品及工艺贴心服务保障，热情接待转达咨询中心！ 参照期刊论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.