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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已表现出丰富的菌物活性酶类，以及抗肺部肿瘤和抵抗疾病毒的作用。一般来说，三萜是按照甲羟戊酸经过制成的，并从具有树木和真菌感染中分离出来。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上发布了题写“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的探索职称论文。该探索出现三萜类单质虫草粉酸（GA）是完成液體培养出来的无柄虫草粉菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的菌物学转变诞生的。用转录组和血清质组学技術进步不断探索无柄虫草粉菌丝体中DHT诞生两者虫草粉酸（GA）的系统，并会按照两组学技術加测到的对比表观遗传和对比血清，预测未来DHT 菌物学聚合 GA 的渠道。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录多组分析和系统分为

利用对无柄灵芝粉白色念珠菌菌丝体采取转录组测序共受到67230个转录本和14296个单遗传表观遗传组。在等单遗传表观遗传组中，492被鉴定会为相互影响表述遗传表观遗传组（DEGs），另外213个表述上涨，279个表述调低（图1A）。GO含有进行分享后，DEGs可以分为生物学整个环节（BP）、血组织组成成分（CC）和团伙基本功能（MF）3类。在BP分类中，有了前6个子分类：抗菌素分解的组织分解整个环节，醋酸钠盐组织分解整个环节和甲酸盐组织分解整个环节;而在CC分类中，血组织外区、突触符合体、突触结构类型是前6个亚类。针对MF分类，甲酸脱氢酶（NAD）生物、硫化重现酶生物和酸氨（或酰胺）进行连接酶生物是前6个亚分类（图1B）。在DEGs的KEGG网络信号环路进行分享中，前30条含有度最低的网络信号环路有27条应属于组织分解，另外二氧化氮组织分解、乙醛酸盐和二羧酸盐组织分解、丙酸盐组织分解网络信号网络信号环路正相关含有（图1D）。

图1|转录类物质析和功能性等级分类

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

根据对无柄野生灵芝细菌菌丝体进入淀粉酶质组学深入定性浅析，共设判断了16,457种不同之处化的肽、2606种淀粉酶质和2588种定量定性浅析淀粉酶质。在阀值|FC|>1.2和p<0.05的选择條件下，你不在2606种淀粉酶质中，94种被监定为不同之处理解淀粉酶（DEPs），在当中52种上涨，42种变动（图2A），图2C提示了不同之处理解淀粉酶的聚类定性浅析法深入定性浅析热图。从GO深入定性浅析而言，BP类属提示，大部份数DEPs进入乙酸盐基础排泄流程、抗菌素做出分解的基础排泄流程和药物剂量做出分解的基础排泄流程。CC类DEPs在受损神经元膜外区、过腐蚀物酶体和微体中增长率较高，腐蚀重置酶几丁质酶和甲酸脱氢酶（NAD）几丁质酶在MF类中DEPs的比倒较高（图2B）。与转录组然而差不多，KEGG径路深入定性浅析提示，好多DEPs在基础排泄中聚集，在当中3条最聚集的前提条件是光合微海洋生物中的碳规定、碳基础排泄和MAPK电磁波径路（图2D）。于此，根据深入定性浅析GO资料库的CC对DEPs进入亚受损神经元膜定位手机深入定性浅析和注解（图2E），DEPs核心区域划分在受损神经元膜质（40.66%）、受损神经元膜膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），理论体系上是GAs微海洋生物镶嵌的核心地点。

图2|营养物质质组的降钙素原检测研究分析和效果查验

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

谋生物流量转化和比对组得票率DEGs和DEPs制作方法了维恩图，有20个对比定性阐述传达遗传人类基因组（图3A）。对转录组和血清质组中E组和C组通用的DEGs/DEPs确定聚类定性阐述定性阐述，出现mRNA和血清质相互间有15-7个调涨遗传人类基因组和5-7个降低遗传人类基因组，DEGs和她翻意的DEPs传达总体水平呈正有关系，源于Pearson的有关系比率定性阐述，在转录组和血清质组相互间的检测到对应较高的有关系性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）验测成果出现，E组和C组1个DEGs的表答爱横向异同可观，中仅9个为上涨DEGs，俩个为调低DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的表答爱现象与转录混合物析成果一致性。

图3|蛋清质组的定量了解了解和职能安全验证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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